1903年，中国神父马相伯在上海创办震旦学院（又名震旦大学、震旦公学），在当时是一所教会大学，在办学上有着诸多限制，之后又因为其他原因，马相伯出走震旦，并在1905年，同社会名流及一起出走的一些教师，在上海创办了复旦公学（当时震旦大学依然存在），这便是复旦大学与震旦大学之间的关系。
补充资料：
震旦大学，原名震旦学院，由马相伯神父于1903年2月27日在上海徐家汇天文台旧址创办，是中国近代第一所私立大学。“震旦”一词出自梵文，意即中国，在英语中，亦有黎明、曙光的含义。马相伯将震旦学院喻作旭日东升，担负着以教育开启中国曙光的重任。1905年，因法国教会干涉校务，马相伯率中方教师与于右任、邵力子等一百三十名学生脱离了震旦公学成立复旦公学，也就是今日的复旦大学的前身。复旦之名来源于“日月光华，旦复旦兮”，也有不忘震旦、复兴中华之意。
复旦大学（Fudan University），位于直辖市上海，是中华人民共和国教育部直属的全国重点大学，中央直管副部级建制。位列国家首批“双一流”（A类）、“985工程”、“211工程”重点建设高校，入选珠峰计划、强基计划、111计划、2011计划、卓越医生教育培养计划、卓越法律人才教育培养计划、国家建设高水平大学公派研究生项目、新工科研究与实践项目、中国政府奖学金来华留学生接收院校、全国首批深化创新创业教育改革示范高校、首批学位授权自主审核单位，九校联盟（C9）、环太平洋大学联盟、中国大学校长联谊会、东亚研究型大学协会、新工科教育国际联盟、医学“双一流”建设联盟、长三角研究型大学联盟、 长三角高校智库联盟创始成员，中国大学智库论坛秘书处单位，是一所国内顶尖的综合性研究型大学。
学校前身是1905年创办的复旦公学，是中国最早由民间自主创办的高等学校之一。1952年院系调整后，学校成为以文理基础教学和研究为主的综合性大学。上海医科大学前身是1927年创办的国立第四中山大学医学院，是中国人自主创办的第一所国立高等医科院校。2000年，复旦大学与上海医科大学合并，组建新的复旦大学。