安徽医科大学王牌专业有生物技术、临床医学、预防医学、临床药学、护理学、医学影像学、口腔医学、药学、医学检验技术、公共事业管理等，以下是具体名单，供大家参考。
安徽医科大学专业一览表| 序号 | 学院 | 所含专业 |
| 1 | 基础医学院 | 基础医学、放射医学 |
| 2 | 公共卫生学院 | 预防医学、妇幼保健医学、食品卫生与营养学、卫生检验与检疫 |
| 3 | 口腔医学院 | 口腔医学 |
| 4 | 卫生管理学院 | 公共事业管理、劳动与社会保障、健康服务与管理（含中外合作办学）、信息管理与信息系统 |
| 5 | 巢湖临床医学院 | 临床医学（农村订单定向免费医学生） |
| 6 | 精神卫生与心理科学学院 | 应用心理学、精神医学 |
| 7 | 药学院 | 药学、中药学、临床药学、药物制剂 |
| 8 | 第一临床医学院 | 临床医学（“5+3” 一体化）、临床医学、麻醉学、医学影像学、医学影像技术、康复治疗学、医学检验技术 |
| 9 | 第二临床医学院 | 临床医学（“5+3” 一体化）、临床医学“5+3”一体化（儿科学）、临床医学、儿科学、眼视光医学、康复治疗学、麻醉学 |
| 10 | 护理学院 | 护理学、助产学、养老服务管理 |
| 11 | 法学院 | 法学 |
| 12 | 生命科学学院 | 生物科学、生物技术 |
| 13 | 生物医学工程学院 | 生物医学工程、医学信息工程、智能医学工程 |
省级特色专业：生物技术、口腔医学、护理学、临床医学（康复医学）、卫生检验与检疫、公共事业管理、麻醉学等。
省级重点学科（19个）：药理学、病原生物学、免疫学、病理学与病理生理学、儿少卫生与妇幼保健学、口腔临床医学、社会医学与卫生事业管理、中药学、老年医学、内科学（消化系病、传染病、血液病）、神经病学、外科学（泌尿外、骨外、普外）、妇产科学等。
国家临床重点专科（12个）：呼吸内科、神经内科、泌尿外科、皮肤科、急诊科、麻醉科、病理科等。