鞭毛是细菌的运动器官，它自细胞膜长出，游离于菌细胞外，由基础小体、钩状体和丝状体三部分组成。鞭毛菌在液体环境下可自由移动，速度迅速。细菌的种类不同，根据鞭毛的数量和在菌体上的位置，可将有鞭毛的细菌分为单毛菌、丛毛菌和周毛菌等。
鞭毛的作用
1.鉴定价值：鞭毛是细菌的运动器官，可用于细菌的鉴定与分类。
2.致病作用：鞭毛运动因运动往往有化学趋向性，可避开有害环境或向高浓度环境的方向移动。
3.抗原性：鞭毛具有特殊H抗原，可用于血清学检查。
原核生物与真核生物鞭毛区别
原核生物鞭毛是细胞表面着生的一至数十条长丝状、波曲的蛋白质附属物，由基体、构型鞘和鞭毛丝三部分组成，具有推动细菌运动的功能，运动为旋转方式。
真核生物鞭毛与原核生物在运动功能上相同，但构造、运动机制等方面有显著区别。真核生物鞭毛由鞭杆、基体和过渡区组成。以挥鞭方式推动细胞运动，能量来源于水解ATP。